Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAMQ00059 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAMQ00059 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAMQ00059 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAMQ00059 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAMQ00059 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFAMQ00059 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms