Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBBP68871 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBBP68871 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBBP68871 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBBP68871 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBBP68871 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBBP68871 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBBP68871 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBBP68871 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBBP68871 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBBP68871 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms