Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms