Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF3P61204 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF3P61204 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF3P61204 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms