Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ROMO1P60602 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms