Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms