Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP9P55211 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms