Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms