Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms