Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms