Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NESP48681 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NESP48681 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NESP48681 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NESP48681 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NESP48681 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NESP48681 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NESP48681 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NESP48681 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NESP48681 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NESP48681 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NESP48681 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NESP48681 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NESP48681 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NESP48681 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NESP48681 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NESP48681 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NESP48681 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NESP48681 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NESP48681 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NESP48681 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NESP48681 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NESP48681 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NESP48681 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NESP48681 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NESP48681 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms