Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms