Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms