Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPR4P46093 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPR4P46093 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPR4P46093 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPR4P46093 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPR4P46093 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPR4P46093 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPR4P46093 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPR4P46093 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPR4P46093 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPR4P46093 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPR4P46093 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPR4P46093 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR4P46093 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR4P46093 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR4P46093 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR4P46093 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR4P46093 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR4P46093 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR4P46093 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR4P46093 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms