Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms