Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TMPOP42166 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPOP42166 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPOP42166 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms