Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms