Protein–RNA interactions for Protein: P40938

RFC3, Replication factor C subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC3P40938 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFC3P40938 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFC3P40938 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFC3P40938 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFC3P40938 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFC3P40938 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFC3P40938 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFC3P40938 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFC3P40938 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFC3P40938 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFC3P40938 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFC3P40938 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFC3P40938 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms