Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM6P40199 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM6P40199 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms