Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAEP38570 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms