Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms