Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms