Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms