Protein–RNA interactions for Protein: P32320

CDA, Cytidine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDAP32320 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDAP32320 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDAP32320 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDAP32320 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDAP32320 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDAP32320 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms