Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms