Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD10P28358 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms