Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX2P28328 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms