Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO1P25800 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO1P25800 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO1P25800 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms