Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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