Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1P21675 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms