Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms