Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms