Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB4P17483 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB4P17483 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms