Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBTFP17480 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBTFP17480 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBTFP17480 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBTFP17480 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBTFP17480 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBTFP17480 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBTFP17480 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBTFP17480 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBTFP17480 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBTFP17480 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBTFP17480 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBTFP17480 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBTFP17480 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBTFP17480 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
UBTFP17480 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
UBTFP17480 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
UBTFP17480 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
UBTFP17480 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBTFP17480 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBTFP17480 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBTFP17480 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBTFP17480 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBTFP17480 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
UBTFP17480 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBTFP17480 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBTFP17480 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBTFP17480 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBTFP17480 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBTFP17480 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBTFP17480 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBTFP17480 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBTFP17480 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBTFP17480 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBTFP17480 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBTFP17480 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
UBTFP17480 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBTFP17480 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBTFP17480 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBTFP17480 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBTFP17480 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBTFP17480 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBTFP17480 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms