Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL2P13500 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms