Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCF2P10911 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCF2P10911 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCF2P10911 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCF2P10911 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCF2P10911 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms