Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms