Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms