Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1RP07333 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms