Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFMP07197 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFMP07197 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFMP07197 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms