Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms