Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG12O94817 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms