Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms