Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP5O75197 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRP5O75197 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5O75197 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5O75197 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5O75197 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5O75197 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5O75197 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5O75197 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5O75197 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5O75197 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5O75197 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5O75197 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5O75197 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5O75197 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5O75197 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5O75197 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5O75197 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5O75197 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5O75197 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms