Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPLO60437 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPLO60437 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPLO60437 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPLO60437 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms