Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF3IP2O43734 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF3IP2O43734 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF3IP2O43734 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF3IP2O43734 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF3IP2O43734 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF3IP2O43734 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF3IP2O43734 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF3IP2O43734 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF3IP2O43734 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF3IP2O43734 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF3IP2O43734 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF3IP2O43734 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms