Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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