Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms