Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNMO15061 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNMO15061 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNMO15061 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNMO15061 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNMO15061 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNMO15061 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYNMO15061 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNMO15061 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNMO15061 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNMO15061 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms