Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms